La Fédération Rhône-Alpes de protection de la nature est créée le 15 juillet 1971, sous l’impulsion de Philippe Lebreton, à partir de quatre associations : le Comité de défense des sites lyonnais ou COSILYO (Ain et Rhône), la Société d’histoire naturelle (Haute -Savoie), la Société pour la sauvegarde des monuments et des sites (Savoie) et la Société des sciences naturelles (Loire). Elle est agréée par le Ministère de l’environnement en 1978 puis reconnue d’utilité publique en 1984. Elle possède l’agrément Jeunesse et Sports et l’agrément Éducation nationale.
En 1996, elle a obtenue l’agrément pour dispenser des formations aux élus locaux.
La fédération se répartit en huit sections départementales : Ain, Ardèche, Drôme, Isère, Loire, Rhône, Savoie et Haute-Savoie. Elle fédère 212 associations.
